Estructura
La CIVP tiene una estructura compuesta de la Secretaría general, la secretaría ejecutiva, los comisionados, el equipo asesor, el equipo técnico y el equipo de comunicaciones.
Secretaria general
El secretario(a) general es el encargado(a) de gerenciar y administrar la CIVP.
Secretaría Ejecutiva
La Secretaría Ejecutiva está encargada del funcionamiento de la Comisión Interétnica de la Verdad de la Región Pacífico y se conforma por un equipo que hace el ejercicio de secretaría permanente. Esta secretaría está integrada por dos representantes de Chocó y uno por cada uno de los departamentos de Valle del Cauca, Cauca y Nariño.
Comisionados por cada una de las Subregiones
La CIVP tiene un equipo de comisionados que ejercen la dirección política. Este equipo está conformado por Autoridades Étnicas, que pertenecen a cada una de las Subregiones. La CIVP tiene en total 11 comisionados(as).
Equipo Técnico
El equipo técnico investigador está compuesto por 4 investigadores profesionales y 10 investigadores locales pertenecientes a las 10 subregiones.
Equipo de comunicaciones
El equipo de comunicaciones está compuesto por un profesional en comunicaciones y un diseñador gráfico.